Secara geografis dan secara administratif Desa Lontar merupakan salah satu dari 7 desa di Kecamatan Kemiri Kabupaten Tangerang, yang memiliki luas wilayah 772 ha (2,98 mil²) dengan jarak keliling sepanjang 13,08 km (8,13 mil), secara astronomi terletak di antara 6°02’12.6″ – 6°04’54.9″ Lintang Selatan dan 106°26’44.3″ – 106°28’14.8″ Bujur Timur, dan secara topografis Desa Lontar merupakan dataran rendah yang berbatasan langsung dengan laut utara Jawa.
Posisi Desa Lontar terletak pada bagian utara Kabupaten Tangerang yang berbatasan langsung dengan sebelah utara Laut Jawa, sebelah timur Desa Karang Anyar, sebelah selatan Jl. Ir. Sutami/Desa Klebet, dan sebelah barat Sungai Cimanceuri/Kecamatan Kronjo.
Jarak dari Desa Lontar ke pusat pemerintahan di atasnya sebagai berikut:
- Jarak dari Pusat Pemerintahan Kecamatan Kemiri (Kemiri): 6,8 km (12 mnt).
- Jarak dari Pusat Pemerintahan Kabupaten Tangerang (Tigaraksa): 30,2 km (1 jam 4 mnt).
- Jarak dari Pusat Pemerintahan Provinsi Banten (Serang): 49,2 km (1 jam 26 mnt).
Dilihat dari pemanfaatan lahan, sebagaian besar berupa tanah kering dan tambak ikan yakni untuk pemukiman Kampung Lontar seluas 19,11 ha (2,47%), Kampung Lojok 1,04 ha (0,14%), Kampung Selatip 11,90 ha (1,54%), Kampung Pajang Kelapa Dua 2,94 ha (0,38%), Empang/Tambak Ikan 266,94 ha (34,58%), Persawahan 337,05 ha (43,66%), Kawasan PLTU 3 Banten 133,02 ha (17,23%).